Agis en de gemeente werken op een aantal gezondheidsprogramma's al enige jaren samen: Gezond gewicht, Big!Move, plan van aanpak Maatschappelijke opvang en Welkome wijken. Deze zijn allemaal ondergebracht onder Utrecht gezond! Daarnaast zijn nieuwe programma's gestart. Sommige programma's zijn voor de hele stad, en andere meer gericht op de aandachtswijken: Overvecht, Noordwest, Zuid, Zuidwest en Leidsche Rijn. Er zijn in totaal 10 gezondheidsprogramma's:

Leefstijlprogramma's zoals Big!Move
Mantelzorg
Alcohol en drugs 
Gezond gewicht
Welkome wijken
Psychosociale gezondheid en zorg
Kindermishandeling
Zorg voor (aanstaande) ouders en kind
Infectieziektebestrijding
Plan van aanpak Maatschappelijke opvang